ידוי אחרון של קשישה גרמנייה חושף סוד מצמרר: בצמרת הממשל בישראל יש בוגד. במשך שנים מסר הבוגד את הסודות החשאיים ביותר של מדינת ישראל. איש לא יודע עד כמה גבוה הוא הגיע ובאילו חוטים הוא מושך. הדבר היחיד הידוע לגביו הוא כינויו, "קוברה".
נשיא המדינה ממנה צוות חשאי שתפקידו לעלות על עקבותיו. בראש הצוות עומד ראש המוסד לשעבר, והוא מגייס למבצע עורך דין בהווה ואיש מבצעים במיל' ולוחמת קרת רוח שהסימן המזהה שלה הוא שרשרת פנינים. בעוד הם מצרפים פרט אל פרט, המפעילים של "קוברה" חשים שהאדמה בוערת ומפעילים את רשת הקורים שלהם, שהיא סבוכה ומסוכנת לכל אחד מחברי הצוות.
בוגד הוא מותחן ריגול ישראלי מבריק ומשובח. ביד בוטחת מנווט מחבר הרומן עלילה אמינה ורבת-מהפכים המתרחשת בישראל, רוסיה וארצות הברית. הגיבורים מפלסים את דרכם בין נאמנויות צולבות, תחכום אסטרטגי ותאוות בצע פשוטה.
יונתן דה שליט הוא שמו הבדוי של סופר שלא ניתן לחשוף את זהותו. בתום דיונים ממושכים קיבל הספר את אישור הצנזורה וועדת השרים למען היתר פרסומים