במכון טיילור, מכון מחקר מדעי קטן ולא מוכר, עוסק צוות מדענים בפעילות מדעית פורצת דרך שעשויה לשנות את פני העולם, עד שפיצוץ מסתורי קוטע אותה. ביום הראשון לבנייתו המחודשת של המכון מודיעים לאריק, הארכיטקט, כי בור גדול נפער באדמת האתר וטרקטור, שהיה עסוק בפינוי שרידי הריסות, נפל לתוך חלל ענקי.
אריק מתחיל לפורר את הר המסתורין שנרקם סביב הפיצוץ ומתוודע אגב כך למהפכה המדעית שעמדו המדענים לחולל, תוך שהם מסתירים בקנאות את גילוייהם המדהימים כדי שאור הזרקורים לא יפריע להם בעבודתם.
הכפיל הווירטואלי הינו רומן מדע בדיוני פילוסופי, נקי מפנטזיה, הפורש סיפור מרתק שבו יצירת מחשב בעלת יכולות אינסופיות היא רק הבסיס המאפשר יצירה של עולם מקביל, על כל תכונותיו, כולל חוקי הטבע. הספר לוקח את הקורא קדימה אל ערפילי הלא נודע שמעבר לקידמה המדעית דהיום ומהווה מעבדה רעיונית לניסויים פילוסופיים מרתקים.