על בבל מפיל את חתתו מסדר הנלחם בנגע איום - מגפת הכתמים האפלים, שמקורה בתהום האורבת במים שמתחת לאדמה.
בממלכה נפוצה שמועה על הגחתו של כוח חדש ומסתורי המכונה "הלוויתן".
אט-אט מתבררים ליונתן ולאלה מקומם ותפקידם בסדר הדברים.
ביצירת פנטזיה אפית מקורית ונועזת, השואלת מוטיבים מן המיתולוגיה היהודית, הבבלית, השומרית והאכזרית ומזקקת מהם יקום והיסטוריה חדשים ומסעירים מגוללת הגר ינאי את קורותיהם של יונתן ואלה, של הילל בן שחר המורד ויורשת העצר נין אורמוז במלחמתם לחופש, לאנושויות ולהגדרה עצמית.
הלוויתן מבבל הוא חלקו הראשון של סיפור עלילה רחב יריעה.
זהו ספרה השלישי של ינאי.