רוברט לנגדון, פרופסור בעל שם עולמי לתורת הסמלים הדתיים מגיע לפריז כדי לתת הרצאה.
בהמשך הערב הוא אמור להיפגש עם האוצֵר הנערץ של הלובר — מוזיאון האמנות החשוב בעולם. אולם האוצֵר אינו מופיע.
מאוחר יותר באותו לילה נקרא לנגדון על ידי המשטרה אל המוזיאון, ושם, בין יצירותיו המופתיות של לאונרדו דה וינצ´י, מתגלה גופתו של האוצֵר, ולנגדון הופך חשוד ברצח.
במוזיאון האפל פוגש לנגדון את סופי נווה - סוכנת המשטרה החשאית המומחית בצפנים. להפתעתם הם מגלים כי סביב לגופה מצויים רמזים מסתוריים שהוצפנו במיוחד עבורם.
המרוץ נגד הזמן החל. הם חייבים לפענח את הצפנים ולהגן על חפותו של לנגדון. הם יוצאים למסע עוצר נשימה, הסוחף אותם מפריז אל לונדון ומעבר להן - בין יצירות אמנות וכנסיות עתיקות, בין מסדרים קדומים וכתות אפלות, בין אבירים, אלות קדושות ודם מלכים. בסוף המסע הם יזכו לגילוי המרעיש ביותר בכל הזמנים, וגם לאמת על הסוד הנצור במשפחתה של סופי.
אבל הם לא היחידים היוצאים בעקבות הצפנים המסתוריים. אם לנגדון וסופי לא יפענחו את החידה בזמן, ימָצאו חייהם בסכנה, ואמת עתיקה תאבד לנצח.