גבעת ווטרשיפ מספר את סיפורם של לוז וחמישון שני ארנבונים אחים החיים יחד בארנבייה שלווה על צלע גבעה. יום אחד חש חמישון הניחן בחוש נבואי שמשהו רע עומד להתרחש. הוא מזהיר את מנהיג הארנבייה אך נתקל באדישות ולגלוג. לוז מחליט לאסוף קבוצת ארנבונים ותחת הנהגתו הם יוצאים לחפש מקום מגורים חדש ובטוח יותר. החבורה האמיצה עוברת קשיים רבים במטרה למצוא להם ארנבייה חדשה מקום שבו יהיו מוגנים מפני אויבים ובני אדם. הם מוצאים ארנבייה שנראית נהדר ומנהיגה בכור-אביב נראה חבר חדש ונאמן אך עד מהרה מתברר שסוד איום עוטף אותה.