עשר שנים לאחר שהופרדו מהוריהם בידי כוח הרסני ואפל, גילו קייט, מייקל ואמה את 'אטלס האיזמרגד', הראשון מבין שלושת ספרי הראשית, ונסחפו למסע הרפתקאות מסחרר. עכשיו הם חוזרים אל בית היתומים בבולטימור - מקום בטוח שבו יוכלו להסתתר מפני המוֹרא–בַּעַת - או כך לפחות חשב ידידם הקוסם סטניסלאוס פים. אבל עד מהרה הילדים מתגלים, וקייט נאלצת להשתמש שוב באטלס האיזמרגד כדי להציל את מייקל ואמה. כוחותיו מטילים אותה מאה שנים לאחור אל ניו–יורק, עיר צבעונית ומלאת קסם. קייט פוגשת שם נער מסתורי, ומגלה כי גורלו קשור בגורלה בקשר חשאי ומסוכן. בינתיים יוצאים מייקל ואמה בעקבות סדרה של רמזים לחיפוש אחר יומן האש, ספר הראשית השני. מסעם מוביל אותם אל קצה העולם, שם הם חוברים אל האֶלפים המרהיבים למלחמה בצבא המבעית של אויביהם. האם יצליחו מייקל ואמה למצוא את יומן האש בזמן וללמוד לשלוט בכוחותיו המופלאים, או שיאבדו את אחותם לנצח?